«Մուտանտներ X» սերիալը պատմում է մուտանտների արկածների մասին, ովքեր գենետիկական ինժեներիայի ոլորտում իրականացված փորձերի արդյունքում դարձել են վտարանդի: Կառավարության անունից գաղտնի իրականացվող գիտափորձերի արդյունքում նրանք ձեռք են բերում գերբնական ուժեր և կարողություններ։Հասկանալով, որ իրավիճակը դուրս է գալիս վերահսկողությունից՝ կազմակերպությունը, որի հրամանով ստեղծվել են այս սուպերմարդիկները, այժմ փորձում է ոչնչացնել իրենց «երեխաներ». Ծրագրի մշակմանն անմիջականորեն ներգրավված գիտնականներից մեկը՝ Ադամը, որոշում է օգնել մուտանտներին։ Նա ստեղծում է չորս մուտանտներից բաղկացած թիմ՝ այսպես կոչված «Mutant X» թիմը։Այս թիմի նպատակն է փնտրել իրենց ցեղակիցներին, օգնել նրանց ընդունել և սովորել կառավարել իրենց արտասովոր հնարավորությունները, ինչպես նաև պաշտպանել դրանք իրենց իսկ ստեղծողներից, մասնավորապես Ադամի գործընկերներից Մեյսոն Էքհարթից: